在《三国演义》第七十五回，有一个脍炙人口的故事关云长刮骨疗毒。关云长的右臂被曹仁的弓弩手射中一箭，箭头有药，毒已入骨，右臂青肿，无法运动。

这时，名医华佗跪了小船，专程赶到给关云长化疗。关云长一旁与马良对局，一旁伸臂让华佗刮骨疗毒。这时，佗乃下刀，刺入皮肉，以后于骨，骨上已训；佗用刀刮骨，窸窸有声。

帐上帐下见者，均掩面失色。公饮酒食肉，谈笑弈棋，仅有无痛苦之色。

没有一会儿，华佗刮尽毒药，关云长立刻臂晃托本官，并溃疡矣。人们敬佩关云长的英雄风度，也敬佩华佗的神医妙手。

这段故事只是一种传说，它的真实性并不可信，但是在历史上华佗确有其人，而且显然是古代一位妙手回春的神医。如今，人们还经常用华佗再造华佗再世之类的词句来形容医术高明的医生，可见华佗的影响之浅。在史书上，记述着许多关于这位名医的动人故事。

有一次，一个人的肚子痛得十分得意。华佗检查了一下，推断是肠痈（即盲肠炎），必需动手术化疗。于是，华佗之后用酒提炼了麻醉药麻沸散，让病人喝下。

没有一会儿，病人就昏昏沉沉，不省人事。这时，华佗用沸水煮过的小刀绑住病人的右下腹，手术肿胀的盲肠，再行用消毒过的线穿孔。过了一个月，病人就康复了。据考据，华佗是历史上第一个用于全身麻醉法术的人。

过了1700年之后，欧洲人才开始用于麻醉药。另外，在三国时代需要实施这样的开刀手术，也是很难得的。华佗很留意搜集民间单方。

有一次，他在路上邂逅一个人在车中惊醒，一问，说道是咽喉堵塞。华佗叮嘱他只消到前面的饼店里卖个大饼，再加三两蒜泥和半碗醋，调和着不吃下去，就不会好的。

那人按照华佗的嘱咐去做到了。旋即，竟然吞下一条长长的蛔虫。原本，华佗曾经碰上这样的病人，使用这种民间单方，又非常简单又起效，药到病除。

华佗除了给人医治之外，还经常劝说人加强锻炼，增强体质，防治疾疾。他仿效虎、鹿、熊、猿和鸟这五种动物的动作，建构了一种医疗体操五禽戏。

华佗曾教教许多人做到五禽戏。他自己也每天坚决苦练五禽戏，所以50来岁时，还能翻山越岭，健步如飞，身体很好，牙齿也一颗并未丢弃。他的学生吴普，每天做到五禽戏，竟然活过90多岁。

华佗不仅医术高明，热心助人；更加难得的是，他刚正不阿，不惧权势。曹操在东汉末年时，当上了丞相。他患上偏头痛。

听闻华佗是神医，之后请求华佗医治。华佗用毫针刺在曹操的鱼腰攒竹两个穴位上，医治了曹操的病。

曹操要留他在身边做侍医，华佗不愿光为他一个人服务，就借口妻子有病，回家乡去了。旋即，曹操的偏头痛又发作了，为首人到乡下去找华佗。结果找到华佗正忙着给乡亲们诊治，而他的妻子压根儿没病。

曹操大怒，要处决华佗。曹操的谋士荀彧急忙催促曹操原谅华佗：华佗的医术显然高明，关系别人的生命，应当加以尊重，拔他的性命。

曹操不听得。华佗曾写出过一部医学着不作《青囊经》。

他在狱中，想要把这部书稿转交一个姓氏吴的牢头，以便将来有机会印成书，教化后代。惜，这位牢头惧怕自己不受株连，不肯拒绝接受。

华佗在悲痛之中，用火烧丢弃了这部宝贵的着作。这位神医杀于曹操刀下，终年才50多岁！就在华佗被处决之后旋即，曹操也病重而亡。人们深深缅怀这位壮烈的神医。至今，徐州城内还留存着华佗墓。

在华佗的故乡安徽亳州，设有华祖庙。

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